Το κλίμα του νησιού είναι μεσογειακό με ήπιο χειμώνα και δροσερό καλοκαίρι. Είναι επίσης υγρό και η βασική αιτία για αυτό είναι οι πολλές βροχοπτώσεις που προκαλούνται λόγω των Βορειοδυτικών ανέμων του πελάγους. Ο καλύτερος χρόνος για να ταξιδέψετε στην Πάτμο εξαρτάται από το είδος της ενασχόλησης που ζητάτε. Εάν θέλετε να κολυμπήσετε στην θάλασσα, τέλη Μαΐου μέχρι τον Σεπτέμβριο είναι ο καλύτερος χρόνος για το ταξίδι σας. Τον Οκτώβριο η θάλασσα είναι ακόμα αρκετά θερμή (20 βαθμούς C), αλλά υπάρχουν συχνές βροχοπτώσεις και ποιος θα ήθελε κάτι τέτοιο στις διακοπές του! Οι περισσότερες βροχοπτώσεις είναι τον Δεκέμβριο, αλλά ως τουρίστας κανονικά δεν θα είστε εκεί. Για ενημέρωση ο Απρίλιος, Μάιος και Σεπτέμβριος είναι οι καλύτεροι μήνες να επισκεφτείτε την Πάτμο.